答：通常不能，因为不是法定扣除凭证。 增值税一般纳税人购进农产品，取得流通环节小规模纳税人开具的增值税普通发票，不得计算抵扣进项税额。但是，增值税一般纳税人从农民专业合作社购进的免税农业产品，可按9%的扣除率计算抵扣增值税进项税额。农民专业合作社，是指依照《中华人民共和国农民专业合作社法》规定设立和登记的农民专业合作社。
  为什么能抵扣，根据《财政部 国家税务总局关于农民专业合作社有关税收政策的通知》（财税〔2008〕81号）：“ 一、对农民专业合作社销售本社成员生产的农业产品，视同农业生产者销售自产农业产品免征增值税。 ”，这种免税发票属于法定增值税扣除凭证（农产品销售发票 ），可按9%的扣除率计算抵扣增值税进项税额。